Единственное затруднение в данном случае, это когда файл образа диска, в том числе в формате Iso, загружен в виртуальный привод. В этом случае, диск нужно размонтировать и только потом, удалять образ. Для этого используйте команды, предусмотренные в программе эмуляторе виртуальных дисков, для данных целей. В крайнем случае, можно убить процесс эмулятора дисков через диспетчер задач, удалить образ в формате Iso, а уж потом пусть эмулятор снова загружается. Но, это варварский способ, который, как правило, не нужен. Каких-то других проблем с этими файлами и их удалением, у меня не возникало.

Вот так, можно удалить файл с расширением Iso.